Master mention Bioinformatique et biologie des systèmes (BBS)
Université de Toulouse III
Toulouse

MASTER / DU
Outil proposé par l’ANEPF

Objectif de la formation

Ce parcours de master comprend deux années proposant une solide formation disciplinaire en Bioinformatique et en Biologie des Systèmes. L’accent est mis sur le traitement et l’intégration des différents types de données Omics, et la modélisation mathématique des réseaux de gènes pour étudier in silico le comportement dynamique du système biologique.

Compétences développées

● Concevoir, gérer et administrer un système d’informations à travers l’administration de bases de données volumineuses et complexes de manière à extraire des informations pertinentes dans le cadre de projets biologiques
● Conceptualiser des problèmes liés à l’analyse de données biologiques complexes et développer des réponses méthodologiques adaptées par leur traduction en terme d’algorithmique et leur implémentation sous forme de solutions logicielles.
● Traiter, intégrer et analyser des données massives, complexes et hétérogènes (génomes, données issues d’expériences à haut débit, données environnementales, épidémiologiques, etc.) produites dans différents domaines de la biologie (santé, agronomie ou environnement) pour en extraire des connaissances facilitant l’aide à la décision et/ou au diagnostic.
● Comprendre et prédire le comportement dynamique d’un système ou processus biologique en représentant les connaissances disponibles dans un modèle mathématique et en confrontant simulations numériques et résultats expérimentaux afin d’aider aux développements d’expérimentations plus ciblées.
Débouchés
L’évolution rapide des technologies dans le domaine des sciences de la vie et la généralisation de ces approches globales dans l’analyse du vivant génèrent dans les laboratoires publics et privés une demande accrue de jeunes cadres possédant des compétences pluridisciplinaires en biologie-informatique-mathématique et pouvant de plus jouer un rôle d’interface au sein de ces laboratoires.
Les débouchés professionnels se situent donc dans les secteurs d’activités privées ou publiques faisant appel aux traitements informatiques et mathématiques des données biologiques, notamment en agroalimentaire, pharmacologie, environnement et santé.

Organisation de la formation

Semestre 3 : fait appel le plus largement possible au travail en autonomie et/ou en groupe et s’appuie sur l’analyse des processus d’acquisition des connaissances scientifiques, des ateliers pratiques et la réalisation de projets. Deux UE portent sur la gestion de données biologiques complexes et une sur une introduction aux approches d’IA. Une UE aborde l’étude de la relation entre évolution des génomes et adaptation à des environnements différents. Deux UE d’initiation à la biologie des systèmes sont organisées sous forme d’ateliers consacrés à différentes problématiques scientifiques d’actualité, abordant, d’une part, les traitements d’intégration des données obtenus par différentes approches à haut débit pour caractériser le système, et d’autre part, les approches de modélisation mathématique pour mieux comprendre son comportement dynamique. La rigueur et la démarche scientifique requises pour réaliser la synthèse de travaux scientifiques et leur présentation sont abordées dans l’UE communication scientifique. Finalement, une UE aborde le développement des compétences transversales nécessaires à une insertion professionnelle réussie.

Semestre 4 : stage de 6 mois
Contrôle de connaissances
Mémoire de stage et soutenance.
Condition admission / Public cible
Bac +3
Licence Science de la Vie ou Licence Informatique
Période approximative de candidature
De mi-avril à début juin
Lieu de formation
Campus Science Toulouse
Coût de la formation
/
Contact
Responsables pédagogiques :
CRESSAULT Yann fsi-contact.formation-continue@univ-tlse3.fr
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