Master In Silico Drug Design : molécules bioactives
Université Paris Cité
Paris

MASTER / DU
Outil proposé par l’ANEPF

Objectif de la formation

Ce parcours forme des professionnels(les) du privé et du public, au niveau français mais aussi européen, acteurs de la recherche par des approches in silico dans le domaine de l’innovation thérapeutique et/ou orientés vers le développement de molécules pharmacologiques.
Ce parcours propose l’ensemble des compétences complémentaires nécessaires au processus de recherche et de conception de nouvelles molécules thérapeutiques et de modélisation computationnelles des macromolécules et de leurs partenaires médicaments. Les étudiants acquièrent les connaissances nécessaires sur les composés chimiques et les cibles thérapeutiques pour la compréhension et la prédiction de leurs interactions et de la modélisation des interactions « médicament-cible » à l’aide des outils in silico. Ils sont formés aux approches telles que la programmation, la chemoinformatique, les biostatistiques, le machine learning, le développement de scripts permettant de chaîner des logiciels, la bioinformatique structurale, les méthodes de simulations de dynamique moléculaire, le criblage virtuel et docking mais aussi à l’application et combinaison de ces différentes méthodes lors de nombreux projets appliqués avec de logiciels de pointe du domaine.

Compétences développées

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Débouchés
Chercheur et manager de projet en bioinformatique structurale, chemoinformatique, biostatistique, modélisation moléculaire, in silico drug design, dans des industries chimiques et pharmaceutiques, dans les laboratoires publics ou privés de recherche et développement en drug design, dans les secteurs pharmaceutiques, des EPST telles que le CNRS, INSERM, INRA, CEA, les milieux hospitaliers.
Ingénieur de plate-forme de chemoinformatique, de criblage, de bioinformatique structurale, analyse de données de la fonction publique spécialisée.

Organisation de la formation

Ce parcours inclut un semestre en chémoinformatique à l’université de Strasbourg, un semestre orienté sur les molécules bioactives à l’université degli studi di Milano. Le semestre 3 orienté sur les approches de drug design et de criblage à l ‘université de Paris et le semestre 4 est un stage d’initiation à la recherche, encouragé à l’étranger.
De nombreux projets tutorés réalisés en groupe sont proposés en M2. Un des objectifs est que les étudiants soient capables d’utiliser un pipeline optimisé pour identifier de nouveaux inhibiteurs d’une cible donnée en combinant les différents outils et approches nécessaires.

Ce parcours offre de formation à l’interface des Sciences du Vivant et de la Chimie par une formation avec de fortes implications dans le domaine de la Santé dont la clé de voûte est l’interdisciplinarité. Cette interdisciplinarité s’appuie sur des masters d’excellence de plusieurs universités françaises et européennes (Paris Diderot, Strasbourg, Degli studi di Milano), des équipes académiques et du privé d’excellence et la participation de nombreux spécialistes internationaux de différents pays.

Semestre 3 (Université de Paris)
– Data analysis in drug design (8 ECTS)
– Analyse et dynamique moléculaire & drug design (7 ECTS)
– Criblage haut-débit :structure & ligand-based (5 ECTS)
– Analyse de l’espace des Molécules (4 ECTS)
– Préparation à la recherche en Drug Design (6 ECTS)

Semestre 4
– Stage (30 ECTS)
Contrôle de connaissances
La modalité de contrôle des connaissances est basée essentiellement sur un examen terminal pour chaque UE mais aussi sur un ensemble de contrôle continue, examen oral, évaluation de projets. L’étudiant a l’opportunité de représenter des épreuves d’UE non acquise, lors d’une seconde session d’examen.
Condition admission / Public cible
Une licence en biologie, chimie, pharmacie, sciences biomédicales (avec un intérêt pour l’informatique) ou informatique (avec des connaissances en chimie ou biologie) sont prérequis. Le M1 et M2 étant enseignés en anglais, un niveau B2 est demandé à l’entrée du M2.
Cette mention de master accueille des étudiants de diverses formations initiales (universitaires ou écoles d’ingénieurs) : biochimie, chimie, biologie, biologie-informatique, secteur médical, pharmacie, sciences biomédicales.
Période approximative de candidature
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Témoignage
Lieu de formation
Paris campus des Grands Moulins
Coût de la formation
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Contact
Responsables pédagogiques :
Anne-Claude CAMPROUX : anne-claude.camproux@u-paris.fr

Secrétariat pédagogique
Cédric DE CASSAN : cedric.de-cassan@u-paris.fr | 01 57 27 82 46
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